Olá pessoal,

A atualização do MySQL 4.1 para o MySQL 5.0 pode ser feita facilmente pelo WHM (cpanel).
Para fazer, siga os passos:

1 – Logue no WHM como root e clique em “Server Configuration / Tweak Settings“. Marque o MySQL 5.
2 – Rode o script /scripts/mysqlup Para ele baixar e instalar a última versão do MySQL5 disponível.
3 – Depois de completar, você deve recompilar suas bibliotecas perl, mysql e apache. Para isso execute os comandos abaixo:
/scripts/perlinstaller –force Bundle::DBD::mysql
e para o apache:
/scripts/easyapache

PS1: Você deve estar ciente que a atualização não é reversíve. Por esse motivo, faça um backup de tudo antes de executar o upgrade.
PS2: Após o upgrade, o MySQL pode não subir.
Eu executei esse procedimento no RHEL4. Não sei se em outras versão o mesmo problema ocorre. Veja o erro:
/etc/init.d/mysql start
Starting MySQLCouldn’t find MySQL manager or server        [FAILED]

Caso ocorra esse erro, edite o arquivo /etc/my.cnf fazendo a seguinte alteração:
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